一、細胞轉染可分為瞬時轉染，穩定轉染等。
1.瞬時轉染是指外源 DNA/RNA 不整合到宿主染色體中，因此一個宿主細胞可存在多個拷貝數，產生高水平的表達，但通常只持續幾天，多用于啟動子和其他調控元件的分析。一般來說，超螺旋質粒 DNA 轉染效率較高，在轉染后 24-72 h 內分析結果，常常用到一些報告系統如熒光蛋白，β半乳糖苷酶等來幫助檢測。
2.穩定轉染是指外源 DNA 既可以整合到宿主染色體中，也可能作為一種游離體存在。盡管線性 DNA 比超螺旋 DNA 轉入量低但整合率高。外源 DNA 整合到染色體中概率很小，通常需要一些選擇性標記反復篩選得到穩定轉染的同源細胞系。
主要有下面幾種方法：化學法：磷酸鈣法、DEAE-右旋糖苷法、陽離子脂質體法；物理法：電穿孔法、顯微注射法、biolistic 顆粒傳遞法；病毒介導法：逆轉錄病毒、腺病毒。
A. 陽離子脂質體法：帶正電的脂質體與核酸帶負電的磷酸基團形成復合物被細胞內吞。
特點：簡單通用，適用性廣，轉染效率高，重復性好，但轉染時需除血清，轉染效率隨細胞類型變化大。由于脂質體復合物與貼壁細胞的接觸機會遠大于懸浮細胞，所以貼壁比懸浮轉染效率要高。懸浮細胞建議使用電穿孔法。
B. 電穿孔法：利用高壓電脈沖對細胞膜的干擾，使其形成利于核酸進入的微孔。
C. 逆轉錄病毒（RNA）：通過病毒中膜糖蛋白和宿主細胞表面的受體相互作用進入宿主細胞，之后反轉錄酶啟動合成 DNA 并隨機整合到宿主基因組中。
特點：穩定轉染，可用于難轉染的細胞、原代細胞，體內細胞等，但攜帶基因不能太大。
D. 腺病毒（雙鏈 DNA）：先和細胞表面的受體結合，繼而在αV 整合素介導下被細胞內吞。
特點：可用于難轉染的細胞。
二、影響轉染的因素：血清 血清影響復合物的形成，降低轉染效率
陽離子脂質體和 DNA 量在使用血清時會有所不同，因此想在轉染培養基中加入血清時要進行條件優化。大部分細胞可以在無血清培養基中幾個小時內保持健康，對于對血清缺乏比較敏感的細胞，可以使用 OPTI-MEM I 培養基。對于對血清缺乏比較敏感的貼壁細胞，建議使用 LIPOFECTAMINE 2000。
1.抗生素
比如青霉素和鏈霉素，是影響轉染的培養基添加物。這些抗生素一般對于真核細胞無毒，但陽離子脂質體試劑增加了細胞的通透性，使抗生素可以進入細胞。這降低了細胞的活性，導致轉染效率低。
2.細胞代數
轉染細胞經過 1-2 次傳代細胞生長旺盛容易轉染，注意貼壁細胞一旦長滿就不好轉染。
3.細胞鋪板密度
一般轉染時，貼壁細胞密度為 70%-90%，懸浮細胞密度為 2*10^6－－4*10^6 細胞/ml 時效果較好。確保轉染時細胞沒有長滿或處于靜止期。鋪板細胞數目的增加可以增加轉染活性和細胞產量。
4.DNA 質量
DNA 質量對轉染效率影響非常大。一般的轉染技術基于電荷吸引原理，如果 DNA 不純，如帶少量的鹽離子，蛋白，代謝物污染都會顯著影響轉染復合物的有效形成和轉染的進行。
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